在历史上，秦始皇医生最大的污点，可能就是焚书坑儒这件事了，也正是因为这个事情，让秦始皇被后世的文人骂了个狗血淋头，不过，如果将责任都归咎于秦始皇，那就有点冤枉他了。

首先来说，秦始皇之所以会下令焚书，则是因为在一次酒宴上，儒生之间因是否实行分封制而产生了争论，淳于越等人主张延续祖宗之法实行分封制，而丞相李斯则主张实行郡县制，李斯还提出，现在天下初定，但学说众多导致百家思潮涌动，不利于天下统治，建议焚毁部分书籍，结果秦始皇听后，便采纳了李斯的这个建议下令焚书。

不过虽说是焚书，但也不是什么书都焚，对于那些不涉及议政的书，比如农业医药占卜等书籍都不在焚烧之列，另外，值得注意的是，当时所有的书籍，包括要被烧毁的，在咸阳的皇宫里都是有备份的，可以说就算秦朝灭亡，只要皇宫不毁，这些书籍就会一直存在，但意想不到的是，后来项羽在咸阳放了一把大火，使得那些古书连同宫殿尽皆被烧毁。

而所谓的坑儒，其实坑杀的是炼丹的方士，并不是儒生，众所周知，秦始皇在称帝之后，便一直幻想着能够长生不老，于是便召集天下的方士为他求仙炼丹，当时有两人在求仙炼丹失败之后，于是串通起来一起逃亡，连坐的有四百六十余人，全部在咸阳活埋。

由此可见，秦始皇只是“焚书”并未“坑儒”，虽说焚书一事业造成了一定的危害，但那是秦始皇为了统一思想，并不是真要损毁典籍，不过虽说真相如此，但焚书坑儒这个真假参半的合成词，却也让秦始皇背了两千多年的黑锅，甚至留下了暴君的骂名。